کاربرد تست جهش CALR

Calreticulin (CALR) Exon 9 Mutation

جهش اگزون 9 کالرتیکولین  (CALR)

Calreticulin  یک پروتئین محلول چند منظوره است که در هموستاز کلسیم نقش دارد، همچنین به پروتئین های تا شده نادرست (Misfolded) متصل می شود و از خروج آنها از شبکه آندوپلاسمی به دستگاه گلژی جلوگیری می کند.

جهش CALR پس از تولد به دست می آید و جهش ارثی نیست.  این بیماری در اثر افزودن یا حذف مقادیر کمی از مواد ژنتیکی به ناحیه ای از ژن به نام اگزون 9 ایجاد می شود. این منجر به پروتئین غیر طبیعی calreticulin می شود.

جهش‌های کالرتیکولین  (CALR)دومین ناهنجاری ژنتیکی شایع (بعد از جهش‌های (JAK2 هستند. جهش‌های درج/حذف سوماتیک در اگزون 9 ژن CALR با چندین اختلال میلوپرولیفراتیو مزمن، از جمله ترومبوسیتمی ضروری (ET) و میلوفیبروز اولیه (PMF) و به ندرت سایر اختلالات سلول‌های بنیادی میلوئید مرتبط است.

در مطالعات منتشر شده تا به امروز، جهش های CALR تقریباً در 20-25٪ از بیماران ET و 30-35٪ از بیماران PMF یافت شده است. اگرچه این جهش نادر است و در کودکان به خوبی شناخته نشده است، 50٪ از بیماران PMF کودکان دارای جهش CALR بودند.این جهش با احتمال کم ممکن است در برخی از سندرم های میلودیسپلاستیک درجه پایین و سایر اختلالات سلول های بنیادی میلوئیدی مانند لوسمی میلومونوسیتی مزمن

(CMML)، لوسمی میلوئید حاد (AML)، سندرم میلودیسپلاستیک (MDS) و لوسمی میلوئیدی مزمن (CML) یافت می شود. در سال 2016، سازمان بهداشت جهانی (WHO) معیارهای تشخیصی خود را برای MPN ها تجدید نظر کرد. وجود جهش اگزون 9 CALR یکی از سه معیار اصلی لیست شده برای تشخیص ET و PMF است.

بیان بیش از حد CARL در انواع تومورهای جامد گزارش شده است و همچنین با فرآیندهای بدخیم تهاجمی تر و پیشرفته تر همراه است.هنوز مشخص نیست که چگونه پروتئین جهش یافته منجر به علائم و نشانه های MPN می شود. در حالی که بیش از 50 نوع جهش CALR یافت شده است، تنها دو نوع رایج مرتبط با MPN ها در آزمایش PCR معمولی گنجانده شده است.

شایع ترین زیرگروه های گزارش شده جهش های CALR شامل جهش نوع 1 (حذف 52 جفت باز) و جهش نوع 2 (درج 5 جفت باز) است. برای این زیرگروه‌های جهش، توالی یابی سنگر اضافی انجام نخواهد شد. برای سایر زیرگروه های جهش، به ویژه غیر نوع 1 و غیر نوع 2، توالی یابی برای تأیید اندازه حذف/درج انجام می شود.

تجزیه و تحلیل مبتنی بر توالی یابی نسل بعدی (NGS) باید همه گونه های جهش را شناسایی کند اما به طور گسترده در دسترس نیست. علاوه بر کمک به تشخیص MPN ها، آزمایش جهش CALR می تواند اطلاعاتی در مورد پیش آگهی فرد ارائه دهد. نشان داده شده است که که اکثر بیماران مبتلا به ET  یا PMF پراکنده که با تغییرات JAK2 یا MPL مرتبط نیست حامل جهش های سوماتیک  CALRهستند. در مقایسه با افراد دارای جهش JAK2، افرادی که دارای جهش CALR بودند، دوره بیماری خفیف‌تری داشتند، علائم و نشانه‌های کمتری از لخته شدن خون (قسمت‌های ترومبوتیک) و بقای بهتری داشتند.

 

کاربرد تست جهش CALR

تست جهش CALR برای کمک به تشخیص و طبقه بندی اختلالات مغز استخوان که منجر به تولید بیش از حد سلول های خونی می شود، استفاده می شود. این اختلالات به عنوان نئوپلاسم های میلوپرولیفراتیو (MPN) شناخته می شوند. همانطور که اشاره شد، جهش های CALR دومین ناهنجاری ژنتیکی شایع مرتبط با دو نوع MPN است: ترومبوسیتمی ضروری (ET) و میلوفیبروز اولیه (PMF).

 

آزمایش برای ناهنجاری های ژنتیکی مرتبط با MPN ها معمولاً به عنوان پیگیری انجام می شود در صورتی که فردی دارای افزایش قابل توجهی هموگلوبین، هماتوکریت، تعداد گلبول های قرمز و/یا پلاکت ها باشد، یا

 یافته های اسمیر خونی که نشان دهنده میلوفیبروز است، همراه با علائم و نشانه های بالینی که نشان دهنده MPN است. آزمایش جهش CALR معمولاً همراه با آزمایش‌های دیگر جهش‌های مرتبط با MPN‌ها، مانند آزمایش‌های جهش BCR-ABL1 و JAK2 انجام می‌شود.

نتایج تست جهش  CALR

مثبت بودن تست جهش CALR به این معنی است که فرد احتمالاً دارای یک نئوپلاسم میلوپرولیفراتیو (MPN)، به ویژه ترومبوسیتمی ضروری (ET) یا میلوفیبروز اولیه (PMF) است. آزمایش‌های دیگری مانند بیوپسی مغز استخوان ممکن است برای تعیین MPN و ارزیابی شدت آن لازم باشد.

نتیجه منفی معمولاً به این معنی است که جهش CALR مورد آزمایش تشخیص داده نشده است. ممکن است نتیجه منفی داشته باشید و همچنان دارای یک جهش غیر معمول CALR باشد که آزمایش نمی تواند آن را تشخیص دهد. همچنین ممکن است، هرچند بعید، این آزمایش نتوانست جهش اگزون 9 CALR را تشخیص دهد. توجه داشته باشید که آنالیز مبتنی بر توالی یابی نسل بعدی (NGS) باید همه گونه های جهش را در ژن CALR شناسایی کند، اما این آزمایش به طور گسترده در دسترس نیست. نتیجه منفی امکان داشتن MPN را رد نمی کند. 10 تا 15 درصد از موارد ترومبوسیتمی ضروری و میلوفیبروز اولیه هیچ ناهنجاری ژنتیکی مشترک مرتبط با آنها ندارند، یعنی برای جهش‌های  JAK2، CALR  و MPL معروف به MPN” سه‌گانه منفی” منفی است.

منابع:

link1

link2